镰仓时代在大学寮举行的释奠已经不供兽肉了．按照中国的惯例是供猪．日本起初供野猪或鹿, 但这不符合日本的国情, 后来就废除了, 以雉代猪．于是释奠之礼也逐渐日本化了．

　　在后醒醐天皇的时候, 在朝廷里开始学习朱子的《论语》新注, 取代了古注．据说朱子新注是由玄慧僧都介绍过来的 (见《尺素往来》) ．但是, 当时朱子已经死了１００ 多年, 对其记录似有怀疑．此前, 在整个镰仓时代, 许多僧侣去中国留学, 新佛教禅宗传入日本, 同时也把宋学带到了日本．镰仓时代以后的禅僧们既学佛典, 又学儒教, 许多人站在二者折衷的立场上．

　　例如, 北条泰时曾就政治问题问师父明惠上人 (公元１１７３—１２３２ 年) ．明惠上人答: ｀古人曰, ＂其身正而影斜, 其政正而国乱, 是少见的＂真正乃无欲也．＇劝北条泰时修身无欲 (《涩柿》) ．这些话出自《论语》｀其身正, 不令而行 (《子路》) 、｀政者正也．子帅以正, 孰敢不正＇ (《颜渊》) 等孔子的话, 并揉合了佛教天真无欲的思想．虎关师练等许多人认为儒与佛在形式上虽然不同, 但根本原理是相同的, 中严圆月 (公元１３００—１３７５) 是这种看法的代表．他说, ｀孔子之道与佛教互为表里, 由性质而论, 如合双璧．＇又说, 若认为儒、佛相斥, 实际是因为｀拘泥其形, 而不通其道＇．

　　虎关师练在《元亨释书》 (公元１３２２ 年) 中说: ｀有人说孔子不讲怪力乱神, 实际上孔子并非完全不讲, 而是慎重．后来的儒家把它理解为完全不讲, 这是非常大的错误．＇虎关师练认为孔子也和佛教一样是讲怪和神的．在室町时代更有人主张神道、儒教、佛教是一致的．